El templo de Reimu ha sido atacado otra vez por youkais, así que la sacerdotisa tendrá que seguir el rastro de sus atacantes, lo que la llevará a otro mundo donde en una mansión se oculta la mente maestra del ataque. Mientras, la maga Marisa también emprenderá el viaje para encontrar a la responsable del ataque, pero será para hacerse con su poder.
Imágenes tomadas de la versión de PC-98 emulada con Neko Project II Kai
Tras el paréntesis del tercer juego, que tenía un enfoque versus, éste vuelve a la jugabilidad del segundo, con un enfoque para un solo jugador, con fases con jefes al final y con la pérdida de una vida por cada impacto recibido. Podrás elegir entre dos personajes jugables, Reimu y Marisa. La jugabilidad de Reimu se enfoca en dispersar sus proyectiles lo máximo posible mientras que Marisa se centra en la potencia de fuego. Cada personaje tendrá dos subarmas entre las que podrás elegir, apareciendo éstas cuando consigues un power-up y disparándose al mismo tiempo que tus armas normales. Cada personaje jugable tendrá su propia historia y diálogos distintos con los jefes, siendo el penúltimo jefe el personaje que no elegiste, que querrá detener al tuyo para que desista en su viaje. Al igual que en el segundo juego, para conseguir el final bueno de cada personaje tendrás que terminarlo sin usar continues, de lo contrario el jefe final se escapará y obtendrás el final malo.
Este juego tiene textos en japonés pero cuenta con una traducción al inglés hecha por fans. Podéis descargar el juego con el parche al inglés en archive.org.
