Este modelo de 3DS disponía de una CPU más potente y añadía dos botones traseros y el C-Stick, un pequeño cilindro de goma que hacía las funciones del stick analógico derecho aun si no se movía del sitio, detectando en su lugar la presión ejercida, sustituyendo al periférico Circle Pad Pro, el cual añadía un segundo stick a la consola. También salió al mercado una versión sin 3D para esta consola en su tamaño XL, la New 2DS XL, la cual esta vez disponía de bisagras para cerrarla.
Para la New 3DS salieron unos cuantos juegos exclusivos que no podía ejecutar la 3DS original, además que los juegos de Super Nintendo de la consola virtual solo estaban disponibles para la New 3DS.