Este episodio empieza donde acabó Half-Life 2, con Gordon y Alyx en la ciudadela de Ciudad 17, el centro de operaciones de la Alianza en la Tierra. El núcleo del reactor está desestabilizado y, si no se hace algo, causará una gran explosión. Gordon y Alyx no tienen tiempo para escapar antes de que ocurra la explosión, así que tendrán que llegar al núcleo del reactor para estabilizarlo. En ese proceso descubren que la Alianza está intentando causar la explosión para usarla como medio de mandar un mensaje a su universo. Alyx conseguirá la información que intentaban enviar y tendrá que llevársela a su padre y a los otros científicos para poder analizarla, pero esta información resulta ser tan importante que los soldados de la Alianza enfocan todos sus esfuerzos en recuperarla, así que Gordon y Alyx deberán escapar de Ciudad 17 mientras son perseguidos de forma incansable.

Este juego cuenta con voces y textos en castellano.

Imágenes tomadas de la versión de PC del juego

Requisitos para PC en la fecha de salida

Requisitos mínimos
Procesador a 1,2 GHz
256 MB de RAM
Sistema operativo Windows 2000/XP/ME/98
Tarjeta de video compatible con DirectX 7
4,5 GB de espacio en el disco duro