Shantae recibe la visita de Risky Boots, quien la acusa de haberle quitado sus armas y su tripulación para descubrir después que es el Pirate Master quien está detrás de todo esto, el anterior capitán de la banda de Risky, quien fue derrotado y sellado antaño por las genios y que ahora busca volver y vengarse de Risky por su traición y por haber usurpado su puesto. Ha sido la magia de genio que Risky le arrebató a Shantae en su último enfrentamiento el que ha hecho que el Pirate Master volviera de la tumba y ahora Shantae deberá unir fuerzas con Risky para derrotarlo de nuevo y, para ello, primero Shantae deberá encontrar y destruir las guaridas del mal que están dándole poder al Pirate Master.
El juego está dividido en distintas islas que se irán desbloqueando según completes las guaridas del mal. Al llegar a una isla primero deberás explorarla y encontrar la manera de acceder a la guarida del mal, lo que suele implicar interactuar con personajes y realizar para ellos ciertas tareas y entregarles objetos. Una vez en la guarida del mal habrá que ir encontrando llaves para abrir las puertas cerradas y habrá un objeto dentro de un cofre que podrás usar para acceder a zonas a las que antes no podías, sustituyendo a las transformaciones de otros juegos de la saga ya que aquí Shantae no cuenta con su magia de genio. Una vez se haya conseguido el objeto podrás alcanzar partes de la guarida a las que antes no podías y, al final, te espera una batalla de jefe y, tras derrotarle, recibirás el mapa de la siguiente isla. Según avance el juego, las tareas que son requeridas para llegar hasta la guarida del mal requerirán que vuelvas a islas anteriores y uses tus nuevos objetos para llegar a donde antes no podías.
Imágenes tomadas de la versión de PC del juego
Shantae aún cuenta con su pelo como arma, pero ahora no puede usar magia, así que tendrá que usar objetos consumibles, entre los que se encuentran armas, un escudo contra proyectiles, leche de monstruo que aumenta temporalmente su ataque y una serie de objetos comestibles que repondrán la salud de Shantae. Estos objetos se pueden comprar pero los enemigos también los soltarán de vez en cuando al ser derrotados. En la tienda también se puede comprar mejoras para aumentar el poder de ataque del pelo de Shantae y para mejorar el daño de los objetos encontrados en las guarida del mal que puedan ser usados como arma. El uso de estos objetos están vínculados a la pulsación de un botón, así que amplían el set de movimientos de Shantae y los que puedan ser usados como arma te permitirán afrontar los enfrentamientos desde otros ángulos, como atacar a distancia o desde arriba. Además, hay disponibles para su compra una serie de movimientos adicionales, incluyendo ese deslizamiento hacia atrás que en el juego anterior empezabas con él y aquí tienes que comprar.
Para aumentar la salud máxima de Shantae deberás reunir a cuatro calamares corazón que estarán escondidos por el mundo y llevarlos a la forja. Para ver la forma verdadera del jefe final de este juego y obtener el final bueno deberás derrotar a todos los Crankerbats, los miembros de la tripulación de Risky Boots transformados en monstruos por la magia negra del Pirate Master, y atrapar esa magia negra. Los Crankerbats también estarán escondidos, pero en la pantalla de selección de islas podrás ver cuantos Crankerbats y cuantos calamares corazón hay en cada isla y cuantos de ellos has encontrado.
Este juego dispone de textos en español.
