Nueve personas participaban en un experimento en el cual se las aislaba en una base para comprobar el comportamiento que un grupo de personas tendrían si viajaran a Marte y vivieran en una base allí. Durante el experiemnto, estas nueve personas han sido secuestradas por una figura misteriosa que viste como un médico de la plaga y se hace llamar Zero. Como parte del experimento sus participantes debían estar incomunicados durante meses porque en una misión en Marte solo podrían establecer comunicación con la Tierra durante una breve ventana de tiempo, por lo que nadie del exterior puede saber lo que ocurre dentro de la base donde tiene lugar el experimento. Zero ha dividido a sus víctimas en grupos de tres y las ha alojado en alas distintas de la base, obligándoles a jugar un juego si quieren salir de la base, pero la condición para que se abra la puerta al exterior es que solo queden tres participantes con vida. Primero les hace a cada equipo votar a que equipo ejecutar, siendo la única forma de que nadie muera el que cada equipo reciba un solo voto y haya un empate. Luego les hará superar Escape Rooms dentro de la base, usando sedantes para dejarlos inconscientes y transportalos por todo el lugar.
El primer equipo está liderado por Carlos, un bombero que participa en el experimento porque necesita la cuantiosa suma que ofrecían como recompensa para el tratamiento de su hermana menor. Le acompañan Akane y Junpei. Junpei ha participado en el experimento porque, al seguir la pista de Akane, descubrió que ella también iba a participar. Akane formó parte del experimento porque sabía que algo terrible iba a pasar en la base y está preocupada por Junpei porque, tras no verlo durante un año tras los eventos de «999: 9 Hours, 9 Persons, 9 Doors«, su amigo de la infancia está muy cambiado, comportándose de una manera cínica y estando dispuesto a sacrificar al resto de participantes para salir de allí.
El segundo grupo está liderado por un misterioso niño con amnesia y con un casco que le cubre toda la cabeza y que no se puede quitar. Le acompañan Eric, un hombre que a primera vista parece un hombre mediocre y cobarde y Mira, una mujer que se muestra inalterable durante esta situación y que es pareja de Eric.
El tercer grupo está liderado por Diana, una enfermera amable que decidió participar en el experimento por la recomendación de una compañera de trabajo y porque necesitaba alejarse y aislarse para no volver con su exmarido abusivo, al que es incapaz de decirle que no. Le acompañan Sigma y Phi, quienes también sabían junto con Akane que algo iba a ocurrir en la base, por lo que acudieron allí tras los hechos de «Virtue’s Last Reward«.
Imágenes tomadas de la versión de PC del juego.
Tendrás un menú donde tendrás que seleccionar las distintas memorias de los tres grupos durante su participación en este macabro juego. Las memorias no están ordenadas cronológicamente y cada una tiene un pequeño diagrama de flujo que te muestra en que parte hay una decisión que provoca una bifurcación en la historia. Hay otro diagrama de flujo que muestra todas las rutas y los sucesos ordenados cronológicamente, pero solo podrás ver allí los eventos de las memorias cuando las hayas completado. Algunas memorias tendrás que desbloquearlas presenciando ciertas partes de otras memorias y hay una serie de códigos que tendrás que obtener en ciertas rutas para avanzar en otras, habiendo un final verdadero tras una de estas rutas. Algunas de las bifurcaciones dependerán del azar, ya que Zero pondrá pruebas a los personajes que solo dependerán de la suerte y que, al fallarlas, morirán. Mecánicamente estas pruebas también dependen del azar, así que la única forma de presenciar el momento en el que ningún personaje muere es probar hasta tener suerte, incluso cuando las posibilidades de tener éxito son ínfimas, aunque es posible que en estos casos el juego esté programado para que haya una mayor posibilidad de éxito de la que parece, porque solo me hicieron falta unos pocos intentos en la prueba con menor probabilidad para obtener el resultado exitoso.
En las secciones de Escape Room habrá que explorar una sala con tal de encontrar la forma de salir de ella. Habrá que recoger objetos para usarlos en ciertas partes de la sala, encontrar documentos con pistas sobre como funcionan los puzzles de la habitación y resolver otro tipo de puzzles que habrá repartidos en la sala y que le dan variedad al juego.
Este juego dispone de voces y textos en inglés y japonés.